A Fővárosi Törvényszék a 2025. március 12-én kihirdetett mindkét ítéletében megsemmisítette a Budapest Főváros Kormányhivatala által hozott határozatokat. 
A Fővárosi Kormányhivatal két – 2024. augusztus 27-én kelt – határozatával visszavonta a Magyarországi Evangéliumi Testvérközösség, mint fenntartó által működtetett Wesley Kincsei Óvoda, Általános Iskola és Gimnázium, valamint a Wesley Kincsei Általános Iskola és Gimnázium működési engedélyét és egyúttal törölte őket az egyházi és magánfenntartású köznevelési intézmények nyilvántartásából. A határozatok indokolása szerint a köznevelési intézmények működéséhez szükséges egyik alapvető (pénzügyi) feltétel nem biztosított.
A Magyarországi Evangéliumi Testvérközösség, mint fenntartó mindkét határozattal szemben kereseti kérelmet terjesztett elő, s a kereseti kérelmeiben a sérelmezett határozatok hatályon kívül helyezését és azt indítványozta, hogy a bíróság kötelezze új eljárás lefolytatására a kormányhivatalt.
A bíróság mindkét ügyben – visszamenőleges hatállyal – megsemmisítette a kormányhivatal határozatát, és megállapította, hogy a határozatok meghozatala során jogszabálysértő módon járt el, hiszen nem folytatta le az intézmények kapcsán a törvényben előírt törvényességi ellenőrzést, és jogszerűtlenül alkalmazta a hivatalból indult, egyszerű megítélésű ügyekre vonatkozó 8 napon belüli döntéshozatal eljárásjogi lehetőségét is. Bár az ügyek a felperes működési engedély módosítására irányuló kérelmével indultak, azt egy feljegyzéssel – úgy, hogy annak tényét nem közölte az érintettekkel – hivatalból induló eljárássá alakította. E bírósági döntések következtében az oktatási intézmények működése jogi értelemben folyamatosnak tekintendő.
Az ítéletekkel szemben fellebbezésnek nincs helye.